Η Σύνοδος Πρυτάνεων των Ελληνικών Πανεπιστημίων, όργανο μη θεσμοθετημένο νομοθετικά αλλά καταξιωμένο ως ενιαία έκφραση των Πανεπιστημίων της χώρας, ιδρύθηκε με πρωτοβουλία των ιδίων των Πανεπιστημίων το 1987, οπότε και άρχισε να λειτουργεί ως ένα forum ανταλλαγής απόψεων και ιδεών.
Η Σύνοδος Πρυτάνεων εκφράζει την έντονη ανησυχία της για τη συνεχή αμφισβήτηση Πρυτάνεων που βρίσκονται αντιμέτωποι με πολύπλοκες προκλήσεις στο πλαίσιο της διαχείρισης του ακαδημαϊκού και διοικητικού έργου.
Το Προεδρείο της Συνόδου για το τρέχον ακαδημαϊκό έτος (από Σεπτέμβριο 2025 έως Σεπτέμβριο 2026) αποτελείται από τον Καθηγητή Χαράλαμπο Μπιλλίνη, Πρύτανη του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, τον Καθηγητή Δημήτρη Παπαγεωργίου, Πρύτανη του Πανεπιστημίου Αιγαίου και τον Καθηγητή Μιχαήλ Ε. Σφακιανάκη, Πρύτανη του Πανεπιστημίου Πειραιώς.